抗联第2路军的反“讨伐”斗争虽然取得了一些胜利，但由于自1938年初开始，敌人的军事“讨伐”日益加紧，抗联部队的处境越来越困难。为了粉碎敌人企图将活动在松花江下游地区的抗联部队“聚而歼之”的阴谋，打通与活动在东南满抗联第1路军和挺进到热河的八路军的联系，中共吉东省委决定第2路军第4军和第5军一部作为主力，包括王荫武部救世军等共680余人，向抗联第10军活动的五常、舒兰地区转移，采取新的军事行动。
1938年5月1日，第4、第5军领导干部在主清召开会议，制定了具体行动计划。这支西征部队分步兵、骑兵两路，统一由吉东省委书记兼抗联第5军政治部主任宋一夫负责政治军事领导，第5军军长柴世荣、第4军军长李延平和副军长王光字等分别负责指挥各部队。7月1日，先遣队出发，7月2日远征部队从勃利具刁翎地区北上，袭击了壮丹江岸三道通，经过激战突破敌人防线。尔后沿四道河子迅速西进，在荒无人烟的高山密林地带艰苦行军150多公里，越过老爷岭，7月8日逼近苇河县楼山镇。7月12日拂晓，西征军出敌下意地发起猛攻，顺利地占领了楼山镇，俘虏伪森林警察中队长以下达40余人，缴获许多枪支弹药和粮食等。随即召开群众大会，宣传抗日救国主张，激发了厂大群众的抗日热情。当西征部队从楼山镇撤出后，敌人从中东路沿线及延寿、方正调来大批日伪军进行追击和堵截。西征部队遂决定分开行动：柴世荣率第5军教导团、第1师第2团及王荫武救世军部队共210人返回勃利县刁翎地区后方基地；关书范率第5军第1师110人南下，准备经过横道河子、老爷岭与第2军第5师会合后再西进；李延平、宋一夫率领第4军第1、2师和第5军第2师共360人继续西进，奔赴五常。
但是，由于继续西进的队伍对这一带的地理情况不熟悉，一度误入延寿县境，多次与敌进行遭遇战。7月末部队复人苇河县境，同南进迷路的第5军第1师巧遇，遂又一起向五常进发，还袭击了珠河县的元宝镇和沙河镇。
这一带尽管曾是抗联第3军的旧游击区，但早已遭到敌人严重破坏，各地修筑起“集团部落”，统治甚严。西怔队伍步、骑兵行动参差，给养困难，只得靠强攻敌人据点来夺取，不断造成伤亡和减员。这时又发生中共吉东省委书记宋一夫叛变投敌事件，造成极坏影响。
8月初，敌人调集3000余名日伪军警进行追击和堵截，西征部队与敌人进行英勇顽强的斗争，8月下旬终于进人五常县冲河山区。但因敌军的重兵封锁和分割包围，无法同闻讯前来接应的抗联第10军靠拢会合，被困馁于荒山野岭之中，仅能以山果野菜充饥，人员减少至200人。为缩小目标，决定第4军与第5军分开活动。第4军继续在五常县山区艰苦斗争，9月下旬遭敌包围，由于作战牺牲、饿毙和逃亡，队伍减员很大。
到11月下旬以后，军长李延平、副军长王光字相继牺牲，第4军参加西南远征的部队损失殆尽。第5军西征部队在向舒兰转移途中遭受严重损失，第1、第2师失掉联系。第2师余部返抵宁安，与第2军第5师会合，一起转战在额穆、敦化一带。
第5军第1师余部于9月初在头道河子渡过壮丹江，11月返回刁翎抗日游击区。其中第1师等部于10月中旬返回壮丹江地区时，在乌斯浑河渡口（今属林口县）遭敌袭击。抗联第5军妇女团冷云等8名战士，为掩护大队转移，猛烈向敌人射击，在子弹打光、后退无路的紧急时刻，宁死不屈，毅然决然地背扶着受伤的战友，步入浪花翻滚的乌斯浑河，溺江捐躯，壮烈殉国。这8位女英雄是：指导员冷云、班长杨贵珍、胡秀芝，原第4军被服厂厂长安顺福，战士郭桂琴、黄桂清、王惠民、李凤善。
“八女投江”的壮烈事迹，激励和鼓舞着广大抗联战士为中华民族的解放而英勇奋斗。
抗联第2路军总部及其所属留守部队 第4军留守处、第5军第3师及第7、第8军等部队，为策应第4、第5军主力西征，保卫后方基地和密营，在周保中的领导下与强敌周旋，展开了激烈的反“讨伐”斗争”。
1938年春，大批日伪军及伪兴安军骑兵部队分路进攻富锦、宝清境内的抗联密营，3月18日，200名日为军和100多名伪兴安军骑兵向主清西沟与宝石河子之间的尖山子第5军密营逼进。负责保卫密营的第3师第8团第1连得知敌人出动的消息，便由连长李海峰、指导员班路遗等带领14名战士向蓝棒山北麓的李炮营出发，途中与敌遭遇，遂占领小孤山迎击敌人。敌人将小孤山四面包围，并以机枪和迫击炮猛烈射击，第：连战士下畏强敌，坚守阵地，打退敌人多次冲锋，临近黄昏时，指导员等多人已先后牺牲，弹药也己打光，双腿被炸断的连氏命令两名总部交通员和另外两名受伤战士转移，然后与冲上的敌人同归于尽。此次战斗共毙伤日军近100人。
不久，抗联第2路军总部为烈士们举行了追悼会，决定将小孤山命名为“十二烈士山”，以纪念为国牺牲的抗联战士。这12名烈士是：李海峰、班路遗、朱雨亭、魏希林、陈凤山、李芳邻、夏魁武、王仁志、张全福、杨德才、王发、李才。
总指挥周保中亲笔写下诗文，悼念这些壮烈殉国的战士。
烈士山战斗之后，敌人继续向山区进犯，由于抗联战士浴血奋战，在这段时间里第5军第3师的密营没有遭到破坏。
1938年6月，日伪在宫锦、主清等地也加紧推行“归屯井户”政策。抗联第2路军总指挥周保中召集干部会议，讨论吉东抗日游击战争形势，并对各军的反“讨伐”斗争作了具体部署。第5军第3师奉命将第8和第9团分开活动。从6月中旬起，第8团100余人由主清抵达桦川县驼腰子地区，活动将近3个月，多次与敌人作战，钳制了敌人，在完成掩护西征部队西迸的任务之后，于9月中旬又回到富锦、宝清地区坚持斗争。第9团在宝清东部与第7军第3师组成第5、第7军联合部队，其任务是在宝清等地相机破坏敌人的交通运输线，进行给养征发和军需品筹集，选择有利时机打击敌人。6～7月间，这支联合部队在宝清南部地区积极开展游击活动，袭击伪警察署，捣毁“集团部落”，截断密（山）宝（清）公路，与敌人作战多次，钳制了大批敌人兵力。8月，敌人进一步加强对富锦、宝清一带的进攻。13日晨，近200名日伪军骑兵在飞机火炮掩护下，突然袭击了抗联小团山子临时看守所。第9团团长戴克正指挥14名战士英勇抗击，激战3小时，团长以下11人壮烈牺牲。此后，联合部队一直处在敌人“讨伐队”的“追剿”之中。经联合部队干部会议研究决定，8月23日留一部在双鸭子坚持活动；80余名骑兵由李文彬、景乐亭两位师长率领奔赴大旗杆，进至富锦、同江一带，与第7军第9、第10团取得联系，并负责筹措给养和服装。
在此期间，第2路军总部警卫部队与在主清活动的第9军第2师联合作战，取得数次胜利。9月初，周保中率领这支部队由主清向依兰、方正地区转移，9月下旬抵达刁翎地区。不久，在与西怔返回的第5军及救世军的部队会合。这时，敌人动用约1个师的兵力寻歼抗联第2路军总部和第5军军部。11月初，敌人调集大批“讨伐队”在数架飞机配合下，对牡丹江岸的五道河子、喀上喀、土城子等进行了为期半个多月的集中袭扰，又向南推进。
周保中率领总部直属部队90多人在牡丹江岸莲花泡、夹皮沟狭小地区，利用森林、山洞等巧妙地与敌人周旋1个多月，同派出去的小分队及第5军军部也中断了联系，形势十分险峻。到12月下旬才转移到牡丹江东岸，摆脱了敌人的“追剿”，同第5、第9军和救世军军部取得联系，共同等划突围斗争。
1939年1月6日，周保中在柳树河子主持召开了中共吉东省委临时会议，着重处理了第5军第1师师长关书范动摇叛变问题，稳定了部队情绪，坚定了克服困难抗战到底的信心。随后，接连打了几次胜仗，部队也受到很大损失。3月，日伪军约6000人，编成10余支“讨伐队”，对第2路军留守部队轮番进行围攻。第2路军处境十分困难。中共吉东省委扩大会议决定，留少数部队在刁翎地区钳制敌人，主力分路向外线转移。4月初，第2路军总部和第4军留守部队开始向宝清、密山方向转移。日军步、骑兵约七八百入跟踪追击。周保中等指挥所部在葫芦葳子（今海林具境内）组织还击，毙伤日军120余人。尔后越过图佳铁路，于6月29日到达宝（清）密（山）附近的蓝棒山临时后方基地。柴世荣率领第5军在向穆棱方向前进中被敌人发觉，遂于泉眼河设优，激战5小时，共歼日伪军约300人。5月初，第5军部队终于到达镜泊湖一带，与第1路军的第3方面军取得了联系，共同开展活动。在舒兰活动的第10军由军长汪雅臣率领于6月化装成伪军，在小南门至九十五顶子山的途中，消灭日军数十名。9月，又在亚布利消灭日伪“讨伐队”100余名，缴获一批武器弹药。抗联第8军在臼伪军频繁的军事“讨伐”和政治诱降之下，到1938年冬各师相继瓦解。
1939年3月19日，早已动摇的军长谢文东率军部部分人员叛变投敌。
随后，副军长腾松柏也投降了敌人，抗联第8军全部瓦解。
（三）抗联第3、第6、第9、第11军的主力部队远征
1937年底至1938年初，北满抗联部队领导人 第3军军长赵尚志、第6军军长戴鸿滨、第11军军长祁致中越界进入苏联国境以后，日伪军对松花江下游地区的进攻有增无减。抗联各军与众多的围攻之敌进行艰苦的奋战和周旋，给予敌人以有力打击，同时自己也受到严重损失。为了突破敌人包围，扭转这种被动局面，中共北满临时省委于1938年6月初作出决定：将第3军由10个师缩编为4个师和1个警卫团；北满抗联各军主力部队立即分批穿越小兴安岭，向西部的海伦地区进行远征，以开辟新的抗日游击区。7月，北满抗联总政治部主任张寿海 钫作耄 诼鼙甭榛 肿诱倏 刹炕嵋椋 怨岢故 赜谧橹 髡 木龆 ?br />参加这次向西远证的有抗联第3、第6、第9、第11军主力部队共700多人。在北满临时省委统一领导下，由张寿海 鸩摺 撼 胫胃倬咛遄橹 秩 小５?军军长李华堂因不同意远征，带领部分队伍潜入深山躲避，后于1939年7月率部携械投敌。
首批远征部队由第3军政治保安师师长常有钧、第9军第2师师长郭铁坚和第9军政治部主任魏长魁率领所部共约150多人组成，已于6月出发。
部队分别渡过松花江，在通河小古洞集结并筹集给养后，即向海伦方向前进。
途中遭敌袭击，魏长魁牺牲。6月底，部队到达庆城九道岗附近时，再次遭到敌人包围。在突围时，常有钧和郭铁坚失掉联系，遂率政保师及第9军第2师第4团部分人员，于9月下旬到达海伦第3军第6师后方，在后来的战斗中，常有钧被叛徒杀害。郭铁坚率领第9军第2师第5团60多名战士空围后，继续前进，由于作战牺牲、饥饿、伤病，在11月到达海伦八道林子时只剩下20余人。
第二批远征的有两支部队：一支由第6军参谋长冯治钢、第2师师长张传福率领的军部教导队和第之师第11团及第1师第6团共